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  • 赵书红
  • 系所

    动物遗传育种系
  • 职称

    二级教授
  • 办公房间

    第一综合楼B203
  • 电子邮件

    shzhao@mail.hzau.edu.cn
  • 讲授课程

    讲授课程 《动物分子生物学》、《家畜育种学》、《猪的遗传改良》、《动物遗传育种进展》、等

个人简介

赵书红,女,河北南皮人。华中农业大学二级岗教授,博士生导师,澳大利亚默多克大学客座教授,国家杰出青年基金获得者,国务院学位委员会第七届学科评议组成员(畜牧),美国康乃尔大学唐氏基金学者。现任动物科技学院动物医学院副院长,兼任国家家畜工程技术研究中心主任、农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室主任、农业部种猪质量监督检验测试中心(武汉)常务副主任、亚洲动植物基因组大会组委,中国畜牧兽医学会动物遗传育种学分会常务理事、副理事长,曾任国际动植物基因组大会组委会大会组委会主席团成员(2009-2011) (Co-Chairs, Animals);国际动物遗传学会比较与功能基因组常务委员会委员;任PLOS ONE, Frontiers in Livestock Genomics,《猪业科学》 等杂志编委;主要从事分子生物学与动物育种方面的教学科研,科技开发与社会服务等。注重发展和应用现代生物技术与产业结合解决家畜的遗传育种问题,在猪功能基因组与育种、猪基因组编辑、山羊基因组研究等方面取得一系列成果。先后承担国家自然科学基金重大项目、重大国际合作及面上项目、教育部创新团队、 “863”、 “973”、欧盟第七框架计划、国际原子能机构项目等部、省级科研项目等20余项。在 《Nature Biotechnology》、《Nature》、《BMC Genomics》、《Journal of Immunology》等杂志上发表文章150余篇,主编或参编教材5部;获授权的国家发明专利20多件,获得国家技术发明二等奖、湖北省技术发明一等奖等多项奖励;2006年入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选,2008年被评为第十届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛优秀指导教师, 2009年入选湖北省有突出贡献中青年专家, 2010年入选国务院特殊津贴专家,2011年获得中国青年女科学家奖、中国青年科技奖及湖北省三八红旗手称号,2012年入选湖北省高端人才培植计划,2015年入选农业部农业科研杰出人才,2016入选科技部领军人才创新团队。先后培养博士、硕士60余名,并派了多名研究生到美国康奈尔大学、英国诺丁汉大学等机构交流,毕业生已在国内外大学、研究所或企业成为骨干。

教育经历

1985.9-1989.6,哲理木畜牧学院(内蒙古民族大学),畜牧学专业毕业,获学士学位
1989.9-1992.6, 吉林农业大学,动物遗传育种与繁殖学专业毕业,获硕士学位
1995.9-1998.6 , 东北农业大学,动物遗传育种与繁殖学专业毕业,获博士学位

工作经历

1992.7-1995.7 华中农业大学畜牧兽医系,助教
1995.9-1998.11 华中农业大学动物科技学院 ,讲师
1998.12-2003.10 华中农业大学动物科技学院 ,副教授,副系主任
2003.07-- 华中农业大学动物科技学院,教授
2005.8-- 华中农业大学动物科技学院,博导,系主任
2005.12-- 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,主任
2010.11-- 华中农业大学动物科技-动物医学院,副院长
2016.12-- 国家家畜工程技术研究中心,主任[留学经历]
2000.7-2001.7 美国依阿华州立大学动物科学系分子遗传组 访问研究
2001.11-2005.5 美国依阿华州立大学动物科学系分子遗传组 Research Associate
2011.10-2012.3 美国康乃尔大学动物科学系遗传生理组 唐氏学者

研究领域

猪功能基因组与育种、猪基因组编辑、山羊基因组研究等。

科研成果

A著作类
1.《动物分子生物学》主编,高等教育出版社, ISBN: 978-7-04-029620-4,2010.12
2.《彭中镇文集》主编,中国农业出版社
3.《动物遗传学》参编,高等教育出版社, ISBN:7040267152 9787040267150, 2009.8
4.《分子遗传学》参编,高等教育出版社
5.《普通遗传学》参编,高等教育出版社
6.《家畜育种学》参编,中国农业出版社
B论文类
1.Changzhi Zhao1, 2*, Xiaoguo Zheng3, 4*, Wubin Qu5*, Guanglei Li1, Xinyun Li1, 2, Yi-Liang Miao1, 2, Xiaosong Han1, Xiangdong Liu1, 2, Zhenhua Li3, 4, Yunlong Ma1, Qianzhi Shao5, Haiwei Li5, Fei Sun, Shengsong Xie, and Shuhong Zhao. CRISPR-offinder: a CRISPR guide RNA design and off-target searching tool for user-defined protospacer adjacent motif. International Journal of Biological Sciences 2017; 13(11): 1470-1478. doi: 10.7150/ijbs.21312
2.Xinyi Liu, Yongliang Wang, Liming Hou, Yuanzhu Xiong, and Shuhong Zhao. Fibroblast Growth Factor 21 (FGF21) Promotes Formation of Aerobic Myofibers via the FGF21-SIRT1-AMPK-PGC1α Pathway. Journal of Cellular Physiology. J. Cell. Physiol. 232: 1893–1906, 2017
3.J. Zhang,* J. H. Chen,* X. D. Liu,* H. Y. Wang,*
X. L. Liu,* X. Y. Li,* Z. F. Wu,† M. J. Zhu,*‡2 and S. H. Zhao. Genomewide association studies for hematological traits and
T lymphocyte subpopulations in a Duroc × Erhualian F2 resource population. J. Anim. Sci. 2016.94:5028–5041
4.Liangliang Fu, Yueyuan Xu, Ye Hou, Xiaolong Qi, Lian Zhou, Huiying Liu, Yu Luan, Lu Jing, Yuanxin Miao, Shuhong Zhao, Huazhen Liu & Xinyun Li. Proteomic analysis indicates that mitochondrial energy metabolism in skeletal muscle tissue is negatively correlated with feed efficiency in pigs. Scientific Reports | 7:45291 | DOI: 10.1038/srep45291
5.Li C, He H, Liu A, Liu H, Huang H, Zhao C, Jing L, Ni J, Yin L, Hu S, Wu H, Li X, Zhao S. Natural Functional SNPs in miR-155 Alter Its Expression Level, Blood Cell Counts, and Immune Responses. Front Immunol. 2016 Aug 2;7:295. doi: 10.3389/fimmu.2016.00295.
6.Yunxia Zhao, Ye Hou, Fei Liu, An Liu, Lu Jing, Changzhi Zhao, Yu Luan, Yuanxin Miao, Shuhong Zhao and Xinyun Li. Transcriptome analysis reveals that vitamin A metabolism in 
 the liver affects feed efficiency in pigs.
 G3: GENES, GENOMES, GENETICS November 1, 2016 vol. 6 no. 11 3615-3624; https://doi.org/10.1534/g3.116.032839
7.H. Wang, Y. Hou, J. Guo, H. Chen, X. Liu, Z. Wu, S. Zhao, and M. Zhu Transcriptomic landscape for lymphocyte count variation in poly I:C-induced porcine peripheral blood. Animal Genetics, 26 NOV 2015 . DOI: 10.1111/age.12379
8.Wei W, Zhang WY, Bai JB, Zhang HX, Zhao YY, Li XY, Zhao SH. The NF-ҡB modulated miR-195/497 inhibit myoblast proliferation by targeting Igf1r/Insr and cyclin genes. J Cell Sci. (2016) 129, 39-50 doi:10.1242/jcs.174235
9.Ruiyi Lin1, Di Wu1, 2, Changzhi Zhao1, Shangshang Chen1, Qian Xiao1, Changchun Li1, Xinyun Li1, Shuhong Zhao.*Inducible overexpression of porcine Homeobox A10 in the endometrium of transgenic mice. Journal of Integrative Agriculture (JIA) , Doi: 10.1016/S2095-3119(15)61169-8
10.Lu Jing, Ye Hou, Hui Wu, Yuanxin Miao, Xinyun Li, Jianhua Cao, John Michael Brameld, Tim Parr & Shuhong Zhao. Transcriptome analysis of mRNA and miRNA in skeletal muscle indicates an important network for differential Residual Feed Intake in pigs. Scientific Reports, 2015, 5:11953(1-14). DOI: 10.1038/srep11953
11.Xiaoyong Du, Bertrand Servin2†, James E Womack3, Jianhua Cao1, Mei Yu1, Yang Dong4,5, Wen Wang, and Shuhong Zhao. An update of the goat genome assembly using dense radiation hybrid maps allows detailed analysis of evolutionary rearrangements in Bovidae. Du et al. BMC Genomics, 2014, 15:625 (page 1-16)
12.Guanglei Li1, Qitao Jia2, Jianguo Zhao2, Xinyun Li1, Mei Yu1, Melissa S Samuel3, Shuhong Zhao, Randall S Prather. and Changchun Li. Dysregulation of genome-wide gene expression and DNA methylation in abnormal cloned piglets. BMC Genomics, 2014, 15:811(pages 1-14)
13.The FAANG Consortium*, Leif Andersson, Alan L. Archibald, Cynthia D. Bottema, Rudiger Brauning, Shane C. Burgess, Eduardo Casas, Hans H. Cheng, Laura Clarke, Christine Couldrey, Brian P. Dalrymple, Christine G. Elsik, Sylvain Foissac, Elisabetta Giuffra§, Martien A. Groenen, Ben J. Hayes, LuSheng S. Huang, Hassan Khatib, James W. Kijas, Heebal Kim,Joan K. Lunney, Fiona M. McCarthy, John C. McEwan, Stephen Moore, Bindu Nanduri, Cedric Notredame, Yniv Palti, Graham S. Plastow, James M. Reecy, Gary A. Rohrer, Elena Sarrapoulou, Carl J. Schmidt, Jeff Silverstein, Ross L. Tellam, Michele Tixier-Boichard, Gwenola Tosser-Klopp, Christopher K. Tuggle§, Johanna Vikki, Stephen White, Shuhong Zhao, Huaijun Zhou. Coordinated international action to accelerate Genome to Phenome- The Functional Annotation of ANimal Genomes (FAANG) Project. Genome Biol. 2015 Mar 25;16:57(pages 1-6). doi: 10.1186/s13059-015-0622-4.
14.Ting Gu1, Meng-jin Zhu1, Martine Schroyen2, Long Qu3, Dan Nettleton3, Dan Kuhar4, Joan K Lunney4, Jason W Ross2, Shu-hong Zhao (共同通讯作者) and Christopher K Tuggle2*. Endometrial gene expression profiling in pregnant Meishan and Yorkshire pigs on day 12 of gestation. BMC Genomics 2014, 15:156 (1-12)
15.Jing Huang a,b, Guojian Mac,1, Liangliang Fu a, Hao Jia a, Mengjin Zhu a, Xinyun Li a, Shuhong Zhao (通讯作者) Pseudorabies viral replication is inhibited by a novel target of miR-21. Virology 456-457 (2014) 319–328
16.Zhao M, Liu XD, Li XY, Chen HB, Jin H, Zhou R, Zhu MJ, Zhao SH. Systems infection biology: a compartmentalized immune network of pig spleen challenged with Haemophilus parasuis. BMC Genomics. 2013 Jan 22;14:46. doi: 10.1186/1471-2164-14-46.
17.Y Feng, L-L Niu, W Wei, W-Y Zhang, X-Y Li, J-H Cao and S-H Zhao (通讯作者). A feedback circuit between miR-133 and the ERK1/2 pathway involving an exquisite mechanism for regulating myoblast proliferation and differentiation Cell Death and Disease (2013) 4, e934; doi:10.1038/cddis.2013.462
18.W Wei, H-B He, W-Y Zhang, H-X Zhang, J-B Bai, H-Z Liu, J-H Cao, K-C Chang, X-Y Li and S-H Zhao. miR-29 targets Akt3 to reduce proliferation and facilitate differentiation of myoblasts in skeletal muscle development. Cell Death and Disease (2013) 4, e668; doi:10.1038/cddis.2013.184
19.Dawson HD, Loveland JE, Pascal G, Gilbert JG, Uenishi H, Mann KM, Sang Y, Zhang J, Carvalho-Silva D, Hunt T, Hardy M, Hu Z, Zhao SH, Anselmo A, Shinkai H, Chen C, Badaoui B, Berman D, Amid C, Kay M, Lloyd D, Snow C, Morozumi T, Cheng RP, Bystrom M, Kapetanovic R, Schwartz JC, Kataria R, Astley M, Fritz E, Steward C, Thomas M, Wilming L, Toki D, Archibald AL, Bed'Hom B, Beraldi D, Huang TH, Ait-Ali T, Blecha F, Botti S, Freeman TC, Giuffra E, Hume DA, Lunney JK, Murtaugh MP, Reecy JM, Harrow JL, Rogel-Gaillard C*, Tuggle CK*.Structural and functional annotation of the porcine immunome. BMC Genomics. 2013 May 15;14:332. doi: 10.1186/1471-2164-14-332.
20.Liu G, Liu R, Li Q, Tang X, Yu M, Li X, Cao J, Zhao S (共同通讯作者). Identification of microRNAs in Wool Follicles during Anagen, Catagen, and Telogen Phases in Tibetan Sheep, PLOS ONE, 2013,DOI: 10.1371/journal.pone.0077801
21.Shuhong Zhao, Mengjin Zhu, and Hongbo Chen. Immunogenomics for identification of disease resistance genes in pigs: a review focusing on Gram-negative bacilli. Journal of Animal Science and Biotechnology 2012, 3:34
22.Yang S, He M, Liu X, Li X, Fan B, Zhao S (共同通讯作者). Japanese encephalitis virus infects porcine kidney epithelial PK15 cells via clathrin- and cholesterol-dependent endocytosis. Virol J. 2013 Aug 12;10:258. doi: 10.1186/1743-422X-10-258.
23.Yang S, Liu X, Li X, Sun S, Sun F, Fan B, Zhao S (共同通讯作者) MicroRNA-124 reduces caveolar density by targeting caveolin-1 in porcine kidney epithelial PK15 cells. Mol Cell Biochem. 2013 Dec;384(1-2):213-9. doi: 10.1007/s11010-013-1800-x
24.Di Wu, Dechao Song, Xinyun Li, Mei Yu, Changchun Li & Shuhong Zhao. Molecular characterization and identification of the E2/P4 response element in the porcine HOXA10 gene. Mol Cell Biochem. 2013 Feb;374(1-2):213-22. DOI 10.1007/s11010-012-1522-5
25.Congcong Li, Huabin He, Mengjin Zhu, Shuhong Zhao, Xinyun Li. Molecular characterisation of porcine miR-155 and its regulatory roles in the TLR3/TLR4 pathways. Dev Comp Immunol. Volume 39, Issues 1–2, January–February 2013, Pages 110–116
26.Yang Dong, Min Xie, Yu Jiang, Nianqing Xiao, Xiaoyong Du, Wenguang Zhang, Gwenola Tosser-Klopp, Jinhuan Wang, Shuang Yang, Jie Liang, Wenbin Chen, Jing Chen, Peng Zeng, Yong Hou, Chao Bian, Shengkai Pan, Yuxiang Li, Xin Liu, Wenliang Wang, Bertrand Servin, Brian Sayre, Bin Zhu, Deacon Sweeney, Rich Moore, Wenhui Nie, Yongyi Shen, Ruoping Zhao, Guojie Zhang, Jinquan Li, Thomas Faraut, James Womack, Yaping Zhang, James Kijas, Noelle Cockett, Xun Xu, Shuhong Zhao(共同通讯作者), Jun Wang & Wen Wang. Sequencing and automated whole-genome optical mapping of the genome of a domestic goat (Capra hircus),Nature Biotechnology,(2012) doi:10.1038/nbt.2478
27.Groenen MA*, Archibald AL*, Uenishi H, Tuggle CK, Takeuchi Y, Rothschild MF, Rogel-Gaillard C, Park C, Milan D, Megens HJ, Li S, Larkin DM, Kim H, Frantz LA, Caccamo M, Ahn H, Aken BL, Anselmo A, Anthon C, Auvil L, Badaoui B, Beattie CW, Bendixen C, Berman D, Blecha F, Blomberg J, Bolund L, Bosse M, Botti S, Bujie Z, Bystrom M, Capitanu B, Carvalho-Silva D, Chardon P, Chen C, Cheng R, Choi SH, Chow W, Clark RC, Clee C, Crooijmans RP, Dawson HD, Dehais P, De Sapio F, Dibbits B, Drou N, Du ZQ, Eversole K, Fadista J, Fairley S, Faraut T, Faulkner GJ, Fowler KE, Fredholm M, Fritz E, Gilbert JG, Giuffra E, Gorodkin J, Griffin DK, Harrow JL, Hayward A, Howe K, Hu ZL, Humphray SJ, Hunt T, Hornshøj H, Jeon JT, Jern P, Jones M, Jurka J, Kanamori H, Kapetanovic R, Kim J, Kim JH, Kim KW, Kim TH, Larson G, Lee K, Lee KT, Leggett R, Lewin HA, Li Y, Liu W, Loveland JE, Lu Y, Lunney JK, Ma J, Madsen O, Mann K, Matthews L, McLaren S, Morozumi T, Murtaugh MP, Narayan J, Nguyen DT, Ni P, Oh SJ, Onteru S, Panitz F, Park EW, Park HS, Pascal G, Paudel Y, Perez-Enciso M, Ramirez-Gonzalez R, Reecy JM, Rodriguez-Za

科研项目

1. 分子育种合作研究及应用平台 2017.03
2. 生猪体系全基因组选择岗位科学家 2017.01
3. 农业部农业科研杰出人才及其创新团队 2016.01
4. “畜禽改良及健康养殖技术”团队 2016.01
5. 农业部猪遗传育种重点实验室条件建设项目 2015.04
6. 绿色山猪肉产业化生产技术研究与开发,湖北省产业化项目, 2015.01
7. 优质抗病大白猪新品种(系)选育、扩繁及产业化,武汉市重点项目, 2015.01
8. “畜禽遗传改良及健康养殖技术研究与应用”团队 2015.01
9. 四个东南亚猪种免疫及生长性状全基因组关联分析与特色基因挖掘 ,国家基金重大国际合作,2014.01
10. 猪骨骼肌中能量代谢三个关键酶活性调控机理及其对猪饲料转化率的作用研究,教育部优先领域项目, 2014.01
11. 湖北省高端人才引领培养计划(第二层次) 2014.01
12. 猪经济性状的功能基因组学研究,863, 2013.01
13. 畜牧学与草地科学学科同行评议选择辅助系统及专家系统建设,国家自然科学基金, 2013.01
14. 猪遗传育种学,国家杰出青年基金, 2011.01
15. 筛选用于提高猪饲料效率的药物作用位点,国际合作, 2011.01
16. 小反刍动物的可持续发展-全基因组关联分析鉴定南方肉用山羊抗寄生虫病关键基因,国际原子能机构, 2011.01
17. 英国Roslin研究生合作3SR项目 2010.01
18. 猪免疫应答相关基因的eQTL作图、功能鉴定及用于优质猪培育的若干关键问题研究,国家基金广东联合基金, 2007.01

主要奖励

1.2016年湖北省技术发明一等奖,排1。
2.2015年湖北省师德先进个人。
3.2012年国家技术发明二等奖,排3。
4.2011年中国青年女科学家奖。
5.2011年中国青年科技奖。
6.2008年湖北省侨联梁亮胜侨界科技奖励基金三等奖。
7.2007年第十届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品优秀指导教师奖。
8.2007年教育部高等学校科学技术奖(自然科学二等奖)。
9.2006年湖北省自然科学二等奖。
10.2002年湖北省自然科学三等奖。

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